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Nanomics Autolab 蛋白组学大队列服务
Large-Scale Proteomics Made Easy

Nanomics Autolab 提供无缝对接的大队列高通量蛋白质组学服务。

 

我们专注于为大规模研究提供高通量、自动化、稳定、可靠的解决方案,。能够以10倍速度和10倍深度对血浆蛋白质组进行全面解析,大幅提升研究效率和数据质量,为大规模样本赋能,助力从生物标志物发现到疾病研究的各个环节。

 

我们的自动化平台能够高效处理大规模研究,让您更快获得可靠的研究洞察。

血浆蛋白组学大队列
​10 x deeper       10 x faster

深度挖掘、全面分析

支持生物标志物发现、

疾病研究等多种应用

灵活、自动化

无论研究规模大小,

都能高效应对

​高性价比

高性价比解决方案,

同时确保高质量的研究成果

高通量

快速处理大量样本,

显著提高研究效率

我们如何保障数据质量?

Proteonano™
quality control system

 

内嵌平台质控系统,实现单个样本层面的全流程实验监控

 

在大队列质谱蛋白质组学实验中,批次效应(即蛋白质测量子组间的定量差异)往往会干扰后续的生物信息学分析,影响研究结果的准确性。

Nanomics 的 Proteonano™ 超高通量蛋白质组学平台,内置质量控制系统(QCS),可实现对每个样本的全面监控,确保数据质量。

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Step 1: 蛋白富集质控

 Recommended sample quality control solution

QC 1:

QC1 为健康人混合血浆样本, 以实现对蛋白富集步骤的监控和可能 的批次间差异矫正(Inter-plate variations)。我们推荐在实验样本中, 在一份装满样本的 96 孔板里面,通常有 3 个 QC1 质控样本的重复样本。

QC 2:

QC2 为健康人混合血浆样本, 且未经 Proteonano™ PlasmaKit 富集(即 neat plasma), 用于监控还原烷基化、 酶解除盐冻干步骤。通常每块 96 孔板设置一个 QC2 样本。

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 QC 3:

QC3 为健康人混合血浆经 Proteonano™ Plasma Kit 富集,还原烷基化、 酶解除盐冻干得到的肽段冻干粉。

Step 2: 蛋白检测质控

实验前 LC-MS/MS 状态监测

为评估 LC-MS/MS 仪器整体状态, 我们采用健康人混合血浆经 Proteonano™ Plasma Kit 富集,还原烷基化、酶解除盐冻干得到的肽段冻干粉作为质控 QC 3。 QC 3 样品使用与实际样本运行相同的方法,主要评价液相色谱质谱性能,通常是每运行 10~20 次 LC-MS/MS ,运行一次 QC 3 样本,LC-MS/MS 实验质控流程图如图 4。

LC-MS/MS status check prior experiments
Step 3:  数据分析质控

批次间差异矫正

高通量蛋白组技术的发展, 使得包含数百个样品的实验成为可能,这有助于提高结果的统计功效,但在样本处理以及数据产出的过程中,将不可避免的引入技术变异导致的偏差,这被定义为“批次效应”。批次效应的潜在来源包括 : 样品制备和数据采集条件差异的影响,例如不同的技术人员、试剂批次或仪器的变化等。它引入了噪声, 降低了检测真实生物信号的统计能力。

Proteonano™ 内置的数据分析工作流, 能够实现 QC 样本在数十个批次间的一致性, 保证 QC 批次间(Interplate %CV)蛋白强度定量中位值 CV<20%,批次内(Intraplate %CV)蛋白强度定量中位值 CV<15%。

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Case study:
通过Proteonano™平台快速稳定开展
蛋白质组大队列实验

我们以一项有 540 个血浆样本的队列为例, 来解释如何通过 Proteonano来实现快速且稳定开展蛋白组学队列研究。

不同批次 QC 样本鉴定量的稳定性和批次间的相关性

 

通过 6 个批次之间 QC1 质控样本(6 个批次共 18 个 QC1 样本), 我们实现对蛋白富集的质控, 从下图 6 可以看出, 批次间的蛋白数量 CV 值中位数小于 10%,蛋白强度定量 CV 值中位数小于 15%。以此来监测整个项目中不同批次间蛋白富集的稳定性。

PGs identified for QC1 samples across 6 batches

Figure 6: PGs identified for QC1 samples across 6 batches

同时, 我们也对整个项目中的 18 个 QC1 样本进行两两之间相关性的分析, 以确保在批次间和批次内的Pearson 相关系数都超过90%。

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Figure 7: Pearson correlation across 18 QC1 samples from 6 batches

我们将全力支持您
发现蛋白质生物标志物
助力从发现到实际应用的每一个关键环节

Step 3:
Translation
Step 2:
Validation
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Step 1:
Discover
clinically validated biomarkers

“Nanomics Autolab卓越中心致力于为基于质谱的大队列临床蛋白质组学研究提供最佳服务。我们以卓越的稳定性、高通量和高性价比,加速推动您的研究进程。”

- 吴昊博士, 珞米生命科技创始人 & CEO

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准备好了吗? 

我们期待与您探讨,看看我们如何为您的研究提供支持,助力实现目标。

珞米蛋白组学专家将与您联系!

珞米生命科技

浙江省杭州市

钱塘区安和药谷6幢5层

+86 19357321977

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