top of page
Orbitrap Astral 质谱仪高通量高深度分析血浆蛋白质组学
—联合 Proteonano™ 蛋白组系统实现稳定检测超 6000 种血浆蛋白
中文
Abstract
基于 Thermo ScientificTM OrbitrapTM AstralTM 质谱仪，联合Proteonano™ 高通量蛋白组前处理系统，开发的高通量、高深度、超多重血浆蛋白质组学检测和分析标准化工作流程。
基于质谱的蛋白质组学发展已经有二十多年的历史，通过蛋白质组学研究发现疾病的生物标记物并用于疾病治疗研究已成为精准医学发展的关键一环。血浆是重要的生物标志物来源之一，但由于血浆中蛋白质动态范围很宽，基于质谱分析时高丰度的蛋白质会影响低丰度蛋白质的检测，因此在分析前需对血浆样本中的蛋白进行富集提取，以减少高丰度蛋白的影响。
通过表面工程化超顺磁性纳米粒子富集是近年来一种全新的低丰度蛋白富集方式，本文中我们将使用珞米生命科技 (Nanomics Biotech) 的 Protenano™ 高通量蛋白组学标准化分析系统 (www.nanomics.bio) 对血浆样本进行制备，同时使用 Orbitrap Astral 质谱进行分析，开发高通量的血浆蛋白质组学分析流程。
样本制备的重现性
考察同一批次制备的不同样品之间的重现性。对编号为 3-8, 11-16, 19-24, 27-32 的 24 个样本进行上机检测。液相色谱柱使用ES906 色谱柱，液相方法采用 24SPD 梯度，柱温箱 50℃，上样体积 2.5 μL（即上样量 500 ng）。质谱参数如表 2 所示，最大离子注入时间依据表 3 中不同的 SPD 进行调整。
图 3 为不同样本的蛋白鉴定量情况，横轴为样本编号，纵轴代表单个样本的蛋白鉴定量。同一批次前处理获得的血浆样本蛋白组鉴定量在 4000 左右，24 个样本蛋白鉴定量的变异系数为 3.44%。
bottom of page