基于Nanomics Proteonano™平台对实验鼠血液样本的蛋白组学应用
我们将使用Proteonano™ 高通量蛋白组学标准化分析系统,结合质谱技术对不同小鼠血液样本进行蛋白质组分析, 开发小鼠血液样本蛋白组学应用场景并建立标准分析流程。
Proteonano™ 高通量标准化蛋白组学平台
小鼠血液样本的蛋白鉴定数和动态范围
结果显示, Proteonano™ 高通量蛋白前处理系统结合质谱对小鼠血清样本蛋白鉴定数量结果为 3791 种蛋白 ; 对小鼠血浆样本蛋白鉴定数量结果为 5406 种蛋白 ; 对小鼠全血样本蛋白鉴定数量结果为 6585 种蛋白 ; 通过与 Neat Plasma 实验结果(未使用 Proteonano™ Kit 小鼠血样蛋白组试剂盒)对比分析, Proteonano™ 高通量蛋白前处理系统可以在单一样本中实现超千重蛋白质的发现,针对不同类型小鼠血液样本的蛋白鉴定数量显著提升(见图二)。
Proteonano™ 平台对小鼠血液样本的浓度信息进行分析, 检测到的蛋白丰度范围已达到 9 个数量级(见图三), 相比传统方法只有 3-5 个数量级,鉴定深度提升了接近 10,000 倍。

Proteonano™ 与 Olink Target 小鼠血样蛋白差异对比
将 Proteonano™ 平台检测出的 6931 种小鼠血样蛋白质与 Olink Target 48&96 Mouse 的检测结果进行对比分析, 发现三种平台处理的小鼠血浆样本均可以检测到 Q08048(Hepatocyte growth factor) 和 P18340(C-X-C motif chemokine 9), Proteonano™与 Olink_Mouse_48 可共同检测到 5 种蛋白质,Proteonano™ 与 Olink_Mouse_96 可共同检测到 29 种蛋白质(见表二)。

Proteonano™ 平台在小鼠血样蛋白质的检测中表现出卓越的优势, 能够检测到 6895 种 Olink_Mouse_48 和 Olink_Mouse_96无法检测到的蛋白质,进一步证实了 Proteonano™ 可以提供更全面、更准确、更深入的蛋白质组数据的能力。
通过填补 Olink Target Mouse Panel 未能捕捉到的蛋白质信息, 加深研究人员系统性的了解小鼠血液中蛋白质的组成, 有助于揭示潜在的生物学机制和新的生物标志物(见图四)。

